Аниме "Владыка Вермилиона: Король алого лотоса" рассказывает о недалеком будущем - 2030 год. Действие происходит в столице Японии. В окрестностях города обнаружен высокочастотный резонанс, а на сам город наползает таинственный и страшный красный туман. Есть теория, что этот туман переносит неизвестный вирус. Подкрепляется она тем, что все, услышавшие резонирующие звуки, засыпают. Причем это касается не только людей, но и животных.

Однако спустя шесть дней начинает казаться, что никакой опасности не было: все заснувшие просыпаются, как ни в чем не бывало, никаких последствий сна не обнаружено. Вроде бы все в порядке, и те районы, которые были запечатаны, начинают вести самую обычную жизни.

Но последствия все же есть - в Токио начинают происходить странные события, явно связанные с красным туманом. На город надвигается что-то странное, обычные дома скрывают все больше тайн. Но есть молодые люди, в крови которых заключена особая сила. Один за другим они начинают высвобождать ее. Чем это закончится?